Par Noémie SolavainPublié le 13/10/2022 à 17h40Mis à jour le 14/10/2022 à 6h12

Niveau de circulation, symptômes, résistance aux vaccins… Retrouvez les principales caractéristiques des sous-variantes d’Omicron qui font actuellement l’actualité

Difficile de s’y retrouver dans la multitude de variants, sous-variants, recombinants… Depuis l’apparition d’Alpha fin 2020, les variants du Covid-19 se succèdent, chassant leur prédécesseur et relançant des vagues d’infection. Actuellement, Omicron est la principale variante préoccupante circulant en France, selon Santé Publique France, et comprend plusieurs sous-lignées : BA.1, BA.2, BA.3…

« Pour la première fois, on assiste peut-être à un basculement du paysage épidémiologique, avec plusieurs sous-variantes d’Omicron émergeant en même temps dans le monde, dont certaines cohabitent au sein d’un même pays », note Antoine Flahault, épidémiologiste et directeur de l’Institut Institut de Santé Globale de l’Université de Genève (Suisse), avec « L’Express ». Dans ce contexte, quelles sont les principales sous-variantes qui circulent actuellement ? Et quelles sont leurs caractéristiques ?

BA.5, le sous-lignage majoritaire

Identifiée en avril en Afrique du Sud, la sous-lignée BA.5 est désormais majoritaire en France et à l’international, selon les dernières données de Santé Publique France. La fatigue, la toux, la fièvre et les maux de tête sont les symptômes les plus courants. « La probabilité de présenter une anosmie (une perte de l’odorat N.D.L.R) et une agueusie (une perte du goût N.D.L.R) » est plus élevée, pointe Santé publique France. « The Women’s Journal » souligne qu’un nouveau symptôme a été rapporté par le professeur Luke O’Neill du Trinity College de Dublin (Irlande) : les sueurs nocturnes. « La maladie est différente parce que le virus a changé, les sueurs nocturnes étant un nouveau symptôme », a-t-il déclaré à la radio irlandaise Newstalk.

Pour la campagne de vaccination de cet automne, la Haute Autorité de Santé (HAS) a donné son feu vert à trois vaccins anti-Covid adaptés à Omicron « dans un contexte épidémique marqué par la circulation majoritaire de la sous-variante BA.5 ». L’OMS a néanmoins nuancé en assurant qu’il n’y avait pas encore suffisamment de données pour pouvoir recommander ces vaccins à ARNm.

À Lire  De nouveaux projets pour le Sportverband Hygie

XBB, le recombinant qui inquiète à Singapour

Détecté fin 2021, XBB est un recombinant résultant de la combinaison de matériel génétique de deux sous-variants différents d’Omicron. Ces dernières semaines, elle a entraîné une recrudescence de l’épidémie de Covid-19 à Singapour : plus de 6.800 cas mercredi (sur une moyenne sur 7 jours glissants), contre moins de 3.000 fin septembre, détaille BFMTV, qui rapporte les données du ministère de la Santé. Cette nouvelle sous-variante a également été détectée en Europe : au Danemark, en Belgique, en Autriche et au Royaume-Uni. « Le nombre de cas graves est resté relativement faible » et il n’y a « aucune preuve que le XBB provoque une maladie plus grave », a déclaré mardi le ministère singapourien.

Selon une étude menée par des scientifiques chinois, pré-publiée le 4 octobre et qui n’a pas encore été revue par des pairs, le XBB recombinant serait particulièrement résistant aux anticorps. Cela signifierait que « les vaccins de rappel conçus sur la base de BA.5 pourraient ne pas fournir une protection à large spectre contre l’infection », rapporte BFMTV.

De nouveaux symptômes avec le sous-lignage BQ.1.1 ?

Ce sous-variant d’Omicron représentait 6% des cas positifs dont la séquence génomique a été analysée fin septembre en France, rapporte Le Parisien. « L’arrivée de la variante BQ.1.1 n’est pas une bonne nouvelle. Elle a la particularité de provoquer des diarrhées et des vomissements », a écrit sur Twitter le pédiatre Rémi Salomon, président de la commission médicale d’établissement de l’Assistance Publique Hôpitaux de Paris, partageant par la même occasion des données qui montrent que cette nouvelle souche progresse. Néanmoins, « aucune donnée fiable ne permet de l’affirmer », dément pour sa part Le Parisien.

Le cas du Khosta-2, cousin du Covid-19

De la même famille virale que le Sars-CoV-2, ce virus a été découvert par des scientifiques américains en Russie entre mars et octobre 2020, rapporte « ça m’intéresse ». Bien qu’à ce jour, aucun cas n’ait encore été détecté chez l’homme, des analyses en laboratoire ont récemment montré que nos cellules pouvaient être infectées. De plus, le virus serait résistant aux anticorps et aux vaccins développés contre le Covid-19 et pourrait avoir des facteurs plus virulents.